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2006 このマンガがすごい！
2006年版のこのマンガがすごい！を、部門ごとに作品名・著者つきで確認できます。
このマンガがすごい！(オトコ編)
| 順位 | タイトル | 著者 |
|---|---|---|
| 1位 | PLUTO（7） | 浦沢直樹×手塚治虫/長崎尚志プロデュース/手塚 眞/手塚プロダクション |
| 2位 | DEATH NOTE（13） | 大場つぐみ/小畑健 |
| 3位 | 失踪日記 | 吾妻ひでお |
| 4位 | 働きマン（2） | 安野 モヨコ |
| 5位 | 鋼の錬金術師 全巻セット(1-27巻) | 荒川弘 |
| 6位 | ホムンクルス DVD通常版 | 山本英夫 |
| 7位 | 新装版 もやしもん（13） | 石川 雅之 |
| 8位 | おおきく振りかぶって（38） | ひぐち アサ |
| 9位 | カラフルピーチ じゃらじゃらキーホルダー 喜怒哀楽シリーズ どぬく | 新井英樹 |
| 10位 | 団地ともお（4） | 小田扉 |
このマンガがすごい！(オンナ編)
| 順位 | タイトル | 著者 |
|---|---|---|
| 1位 | ハチミツとクローバー（9） | 羽海野チカ |
| 2位 | のだめカンタービレ 新装版（1） | 二ノ宮 知子 |
| 3位 | NANA 1-21巻セット | 矢沢あい |
| 4位 | バルバラ異界（3） | 萩尾 望都 |
| 5位 | プライド 警官の宿命 | 濱 嘉之 |
| 6位 | 【全巻セット】大奥 1-19巻セット | よしながふみ |
| 7位 | フラワー・オブ・ライフ（第1巻） | ドランヴァロ・メルキゼデク/脇坂りん |
| 8位 | きせかえユカちゃん（6） | 東村アキコ |
| 9位 | 安野モヨコ選集 シュガシュガルーン（5） | 安野 モヨコ |
| 10位 | 舞姫 テレプシコーラ 1 | 山岸 凉子 |